MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Staphylococcus aureus subsp. aureus T0131 chromosome

Total Repeats: 69566

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017347	ATT	2	6	125	130	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017347	AC	4	8	148	155	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
3	NC_017347	AC	3	6	234	239	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_017347	TG	3	6	307	312	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_017347	GTC	2	6	318	323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017347	ATTT	2	8	344	351	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_017347	TAA	2	6	384	389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017347	GTT	2	6	411	416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017347	ATT	2	6	432	437	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017347	GT	3	6	444	449	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017347	GTT	2	6	466	471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017347	AAGA	2	8	497	504	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
13	NC_017347	TAT	2	6	641	646	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
14	NC_017347	CAA	2	6	679	684	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868589
15	NC_017347	TGT	2	6	717	722	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868589
16	NC_017347	TAC	2	6	750	755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868589
17	NC_017347	GAA	2	6	757	762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
18	NC_017347	TAA	2	6	777	782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868589
19	NC_017347	CAA	2	6	806	811	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868589
20	NC_017347	AAC	2	6	825	830	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868589
21	NC_017347	AG	3	6	853	858	50 %	0 %	50 %	0 %	384868589
22	NC_017347	ATT	2	6	969	974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
23	NC_017347	ATGC	2	8	1012	1019	25 %	25 %	25 %	25 %	384868589
24	NC_017347	TCA	2	6	1026	1031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868589
25	NC_017347	ATA	2	6	1040	1045	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868589
26	NC_017347	TTA	2	6	1097	1102	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
27	NC_017347	TTA	2	6	1162	1167	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
28	NC_017347	GAT	2	6	1171	1176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868589
29	NC_017347	AAG	2	6	1208	1213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
30	NC_017347	AGA	2	6	1302	1307	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
31	NC_017347	TTG	2	6	1340	1345	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868589
32	NC_017347	CCA	2	6	1354	1359	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868589
33	NC_017347	AGA	2	6	1388	1393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
34	NC_017347	GAA	3	9	1399	1407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
35	NC_017347	CCA	2	6	1420	1425	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868589
36	NC_017347	TA	3	6	1438	1443	50 %	50 %	0 %	0 %	384868589
37	NC_017347	CAAAT	2	10	1445	1454	60 %	20 %	0 %	20 %	384868589
38	NC_017347	ATT	2	6	1512	1517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868589
39	NC_017347	CTG	2	6	1544	1549	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868589
40	NC_017347	A	6	6	1610	1615	100 %	0 %	0 %	0 %	384868589
41	NC_017347	A	7	7	1659	1665	100 %	0 %	0 %	0 %	384868589
42	NC_017347	AG	3	6	1714	1719	50 %	0 %	50 %	0 %	384868589
43	NC_017347	GAA	2	6	1750	1755	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
44	NC_017347	TGG	2	6	1758	1763	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868589
45	NC_017347	TCAT	2	8	1781	1788	25 %	50 %	0 %	25 %	384868589
46	NC_017347	A	6	6	1796	1801	100 %	0 %	0 %	0 %	384868589
47	NC_017347	AGA	2	6	1818	1823	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
48	NC_017347	AAG	2	6	1838	1843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868589
49	NC_017347	TA	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017347	TAA	3	9	1920	1928	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017347	T	6	6	1935	1940	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_017347	CCA	2	6	2071	2076	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017347	CTA	3	9	2088	2096	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_017347	TA	3	6	2116	2121	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_017347	TA	4	8	2124	2131	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_017347	TAAT	2	8	2150	2157	50 %	50 %	0 %	0 %	384868590
57	NC_017347	ATT	2	6	2181	2186	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
58	NC_017347	TTA	2	6	2187	2192	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
59	NC_017347	AAC	2	6	2230	2235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868590
60	NC_017347	AGT	2	6	2380	2385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
61	NC_017347	TTG	2	6	2403	2408	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868590
62	NC_017347	A	7	7	2416	2422	100 %	0 %	0 %	0 %	384868590
63	NC_017347	ATTA	2	8	2470	2477	50 %	50 %	0 %	0 %	384868590
64	NC_017347	AATTT	2	10	2493	2502	40 %	60 %	0 %	0 %	384868590
65	NC_017347	TTA	2	6	2531	2536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
66	NC_017347	CAATT	2	10	2559	2568	40 %	40 %	0 %	20 %	384868590
67	NC_017347	GACT	2	8	2692	2699	25 %	25 %	25 %	25 %	384868590
68	NC_017347	AGA	2	6	2731	2736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868590
69	NC_017347	TCA	2	6	2757	2762	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868590
70	NC_017347	TAAA	2	8	2787	2794	75 %	25 %	0 %	0 %	384868590
71	NC_017347	GAA	2	6	2810	2815	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868590
72	NC_017347	TCT	2	6	2826	2831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868590
73	NC_017347	TTTA	2	8	2848	2855	25 %	75 %	0 %	0 %	384868590
74	NC_017347	ATT	2	6	2884	2889	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
75	NC_017347	ACA	2	6	2909	2914	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868590
76	NC_017347	AAATT	2	10	2937	2946	60 %	40 %	0 %	0 %	384868590
77	NC_017347	TTA	2	6	2993	2998	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
78	NC_017347	GGT	2	6	3008	3013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868590
79	NC_017347	TTA	2	6	3021	3026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868590
80	NC_017347	TGA	2	6	3040	3045	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
81	NC_017347	GTT	2	6	3047	3052	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868590
82	NC_017347	TCT	2	6	3059	3064	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868590
83	NC_017347	AGA	2	6	3091	3096	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868590
84	NC_017347	GGT	2	6	3119	3124	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868590
85	NC_017347	TTCA	2	8	3136	3143	25 %	50 %	0 %	25 %	384868590
86	NC_017347	AT	3	6	3151	3156	50 %	50 %	0 %	0 %	384868590
87	NC_017347	GATG	2	8	3157	3164	25 %	25 %	50 %	0 %	384868590
88	NC_017347	ATG	2	6	3183	3188	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
89	NC_017347	GTTGAA	2	12	3191	3202	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868590
90	NC_017347	TTC	2	6	3203	3208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868590
91	NC_017347	GAC	2	6	3245	3250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868590
92	NC_017347	AATT	2	8	3261	3268	50 %	50 %	0 %	0 %	384868590
93	NC_017347	ATAAAT	2	12	3292	3303	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017347	ATTA	2	8	3317	3324	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017347	T	6	6	3340	3345	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017347	AAT	2	6	3352	3357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_017347	AAAT	2	8	3374	3381	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017347	TAA	2	6	3447	3452	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_017347	A	7	7	3537	3543	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017347	A	6	6	3563	3568	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_017347	AATT	2	8	3573	3580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017347	A	7	7	3629	3635	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_017347	AT	3	6	3642	3647	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_017347	ATT	2	6	3673	3678	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_017347	AAG	2	6	3686	3691	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868591
106	NC_017347	GTA	2	6	3694	3699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868591
107	NC_017347	ATT	2	6	3742	3747	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868591
108	NC_017347	TGG	2	6	3753	3758	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868591
109	NC_017347	ATTA	2	8	3792	3799	50 %	50 %	0 %	0 %	384868591
110	NC_017347	TTCT	2	8	3882	3889	0 %	75 %	0 %	25 %	384868591
111	NC_017347	TCAT	2	8	3893	3900	25 %	50 %	0 %	25 %	384868591
112	NC_017347	ATG	2	6	3952	3957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868592
113	NC_017347	A	6	6	4176	4181	100 %	0 %	0 %	0 %	384868592
114	NC_017347	GTC	2	6	4216	4221	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868592
115	NC_017347	AT	3	6	4229	4234	50 %	50 %	0 %	0 %	384868592
116	NC_017347	AGA	2	6	4265	4270	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868592
117	NC_017347	CTC	2	6	4291	4296	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	384868592
118	NC_017347	GAC	2	6	4303	4308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868592
119	NC_017347	CTG	2	6	4339	4344	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868592
120	NC_017347	AAT	2	6	4392	4397	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868592
121	NC_017347	A	7	7	4423	4429	100 %	0 %	0 %	0 %	384868592
122	NC_017347	AAG	2	6	4564	4569	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868592
123	NC_017347	ATT	2	6	4582	4587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868592
124	NC_017347	GAA	2	6	4635	4640	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868592
125	NC_017347	ATA	2	6	4660	4665	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868592
126	NC_017347	GAT	2	6	4713	4718	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868592
127	NC_017347	TTA	3	9	4848	4856	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868592
128	NC_017347	GAT	2	6	4878	4883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868592
129	NC_017347	TTA	2	6	4899	4904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868592
130	NC_017347	ACA	2	6	5059	5064	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868593
131	NC_017347	GTAT	2	8	5131	5138	25 %	50 %	25 %	0 %	384868593
132	NC_017347	AG	4	8	5153	5160	50 %	0 %	50 %	0 %	384868593
133	NC_017347	ATA	2	6	5191	5196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	384868593
134	NC_017347	CAAAT	2	10	5224	5233	60 %	20 %	0 %	20 %	384868593
135	NC_017347	GTT	2	6	5238	5243	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868593
136	NC_017347	A	6	6	5308	5313	100 %	0 %	0 %	0 %	384868593
137	NC_017347	TGG	2	6	5357	5362	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868593
138	NC_017347	CGG	2	6	5369	5374	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384868593
139	NC_017347	TGG	2	6	5393	5398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868593
140	NC_017347	TCA	2	6	5415	5420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868593
141	NC_017347	TA	3	6	5474	5479	50 %	50 %	0 %	0 %	384868593
142	NC_017347	TCA	2	6	5480	5485	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868593
143	NC_017347	A	6	6	5493	5498	100 %	0 %	0 %	0 %	384868593
144	NC_017347	AAG	2	6	5521	5526	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
145	NC_017347	AG	3	6	5631	5636	50 %	0 %	50 %	0 %	384868593
146	NC_017347	TGA	2	6	5684	5689	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868593
147	NC_017347	AGA	2	6	5702	5707	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
148	NC_017347	ATG	2	6	5776	5781	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868593
149	NC_017347	TCA	2	6	5795	5800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	384868593
150	NC_017347	GAT	2	6	5808	5813	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868593
151	NC_017347	TACG	2	8	5888	5895	25 %	25 %	25 %	25 %	384868593
152	NC_017347	GGT	2	6	5898	5903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	384868593
153	NC_017347	AGA	2	6	5978	5983	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
154	NC_017347	TATC	2	8	6034	6041	25 %	50 %	0 %	25 %	384868593
155	NC_017347	ATT	2	6	6119	6124	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
156	NC_017347	TAT	2	6	6191	6196	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
157	NC_017347	GGC	2	6	6197	6202	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	384868593
158	NC_017347	TGC	2	6	6215	6220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868593
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161	NC_017347	GAA	2	6	6312	6317	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
162	NC_017347	G	6	6	6351	6356	0 %	0 %	100 %	0 %	384868593
163	NC_017347	TAGA	2	8	6439	6446	50 %	25 %	25 %	0 %	384868593
164	NC_017347	TGGA	2	8	6565	6572	25 %	25 %	50 %	0 %	384868593
165	NC_017347	TTA	2	6	6591	6596	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
166	NC_017347	TTC	2	6	6600	6605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868593
167	NC_017347	TAT	2	6	6693	6698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868593
168	NC_017347	TGAAT	2	10	6734	6743	40 %	40 %	20 %	0 %	384868593
169	NC_017347	AATG	2	8	6788	6795	50 %	25 %	25 %	0 %	384868593
170	NC_017347	ACA	2	6	6813	6818	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868593
171	NC_017347	AGA	2	6	6932	6937	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	384868593
172	NC_017347	TGAAC	2	10	6975	6984	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
173	NC_017347	AGG	2	6	6991	6996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
174	NC_017347	TCAA	2	8	7019	7026	50 %	25 %	0 %	25 %	384868594
175	NC_017347	TCG	2	6	7142	7147	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868594
176	NC_017347	A	6	6	7197	7202	100 %	0 %	0 %	0 %	384868594
177	NC_017347	TATC	2	8	7255	7262	25 %	50 %	0 %	25 %	384868594
178	NC_017347	GTTATC	2	12	7297	7308	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	384868594
179	NC_017347	TTG	2	6	7312	7317	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	384868594
180	NC_017347	ATGG	2	8	7341	7348	25 %	25 %	50 %	0 %	384868594
181	NC_017347	GCA	3	9	7356	7364	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	384868594
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183	NC_017347	ATG	2	6	7453	7458	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868594
184	NC_017347	AG	3	6	7467	7472	50 %	0 %	50 %	0 %	384868594
185	NC_017347	GGTA	2	8	7532	7539	25 %	25 %	50 %	0 %	384868594
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188	NC_017347	CTG	2	6	7663	7668	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	384868594
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244	NC_017347	A	7	7	9667	9673	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
245	NC_017347	G	6	6	9693	9698	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
246	NC_017347	CTATA	2	10	9725	9734	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
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250	NC_017347	CAA	2	6	9902	9907	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868595
251	NC_017347	ACC	2	6	9942	9947	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868595
252	NC_017347	T	6	6	10017	10022	0 %	100 %	0 %	0 %	384868595
253	NC_017347	ACA	2	6	10027	10032	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868595
254	NC_017347	GTA	2	6	10229	10234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868595
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256	NC_017347	GTCA	2	8	10296	10303	25 %	25 %	25 %	25 %	384868595
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259	NC_017347	CCA	2	6	10480	10485	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	384868595
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261	NC_017347	TCT	2	6	10522	10527	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	384868595
262	NC_017347	AT	3	6	10619	10624	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
263	NC_017347	TAT	2	6	10644	10649	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
264	NC_017347	ATT	3	9	10664	10672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
265	NC_017347	ATT	2	6	10730	10735	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
266	NC_017347	ACA	2	6	10746	10751	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
267	NC_017347	ATA	2	6	10789	10794	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
268	NC_017347	AAG	2	6	10849	10854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
269	NC_017347	AT	3	6	10887	10892	50 %	50 %	0 %	0 %	384868596
270	NC_017347	ACA	3	9	10947	10955	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	384868596
271	NC_017347	ATT	2	6	10969	10974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868596
272	NC_017347	GAT	2	6	10975	10980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	384868596
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281	NC_017347	TAT	2	6	11277	11282	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	384868596
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